駅構内で盗撮していたところ、鉄道警察に取り押さえられました。今後どうなってしまうのでしょうか？

まず被疑者の取り調べは鉄道警察が行うことになります。ただし、鉄道警察には検察庁への送致権がないため、とりあえず取り調べが終了したら、最寄りの警察に取り調べた内容を引き継ぎ、その引き継がれた警察担当者によって管轄の検察庁に送致されることになります。